Wat is SeqNeth?

SeqNeth is het acroniem voor Sequencing Network Netherlands waarmee het netwerk wordt bedoeld van Nederlandse microbiologische laboratoria waar sequentie analyse wordt uitgevoerd van SARS Coronavirus type 2 (SARS-CoV2) . SeqNeth is in opdracht van het ministerie voor Volksgezondheid, Welzijn en Sport (VWS) opgericht begin 2021. Op dit moment hebben al een aantal Nederlandse laboratoria expertise op het gebied van sequentieanalyse van SARS-CoV-2.

Waarom sequentie analyse?

Sequentieanalyse van het genoom van SARS-CoV2 wordt sinds het begin van de pandemie uitgevoerd. Doel hiervan is onder meer het verkrijgen van inzicht in nieuwe introducties, verspreiding van varianten, transmissieketens, het optreden van herinfecties of vaccin doorbraken en uitbraken in ziekenhuizen, verpleeghuizen en andere plaatsen in een gemeenschap. Met het ontstaan van varianten die mogelijk besmettelijker zijn, de immuniteit ontwijken of andere veranderde eigenschappen vertonen wordt de genetische karakterisering van SARS-CoV-2 steeds belangrijker.

Waarom een netwerk?

Het doel van dit netwerk is het inrichten van een flexibele en opschaalbare organisatie die gezamenlijk en tijdig SARS-CoV2  sequentie data verzamelt en deelt ten behoeve van publieke gezondheid, patiëntenzorg en wetenschap. Het netwerk is belangrijk bij de bestrijding van SARS-CoV-2 maar kan in de toekomst ook relevant zijn bij andere ‘emerging infections’. Behalve delen van sequentie data is het ook de bedoeling dat binnen het netwerk kennis snel gedeeld kan worden om bijvoorbeeld typerings-assays voor de detectie van varianten aan te kunnen passen wanneer dat nodig is. Daarnaast is het netwerk uitermate geschikt voor regionale surveillance en het in kaart brengen van regionale uitbraken in instellingen, waarbij regionale laboratoria lokale GGD’s ondersteunen bij uitbraakbestrijding, maar data ook nationaal ter beschikking komen. Daarnaast verzorgt het netwerk trainingen om WGS capaciteit in Nederland te vergroten.