Descartes centrum,
Matthias van Geunsgebouw
Bolognalaan 2, 3584 CJ Utrecht
Aanmelden
DOWNLOAD VOORLOPIG PROGRAMMA
Dag 1
maandag 27 januari 2025
Viraal WGS
Van sample tot resultaat
Opening en Welkom
Richard Molenkamp en Janke Schinkel (Coördinatoren WP 6 Hera2)
Introductie in WGS
Sander van Boheemen (Erasmus MC)
Nanopore sequencing voor virus typering
Marcel Jonges (Amsterdam UMC)
Introductie bio-informatica
Ellen Carbo (Amsterdam UMC) en Boas van der Putten (RIVM)
Analyse van viraal WGS met commerciële software
Suzan Pas (Radboud MC)
Introductie in fylogenie
Jelle Koopsen (GGD Amsterdam)
WGS en fylogenetische analysis ten behoeve van publieke gezondheid en infectiepreventie: Transmissie van SARS-CoV-2 in nertsenfokkerijen en binnen ziekenhuizen
Bas Oude Munnink (Erasmus MC)
Dag 2
Dinsdag 28 januari 2025
Bacterieel WGS
van sample tot resultaat
Whole genome sequencing van bacteriën met Illumina
Sebastien Matamoros (Amsterdam UMC)
Laboratorium infrastructuur en kwaliteit
Robin van Houdt (Amsterdam UMC)
Algemene bioinformatica voor analyse van bacteriën
Casper Jamin (Maastricht UMC) en Pieter Koopman (Radboud MC)
Hoe moet ik mijn bioinformatische structuur opzetten?
Karim Hajji (RIVM) en Florian Zwagemaker (RIVM)
Toegevoegde waarde van WGS voor bacteriële pathogenen binnen en buiten het ziekenhuis
Lieke van Alphen (Maastricht UMC)
Valkuilen bij het toepassen van WGS voor bacteriële pathogenen: cases
Lieke van Alphen, Suzan Pas en Robin van Houdt
Dag 3
Woensdag 29 januari 2025
Toepassingen van WGS
in publieke gezondheid en infectiepreventie
Viral metagenomics and target enrichment
Rob Schuurman (UMC Utrecht)
Metagenomisch sequensen in rioolwater: het ‘urban sewage’ project
Nathalie Worp (ErasmusMC)
WGS in het kader van de Influenza surveillance
Ron Fouchier (ErasmusMC)
WGS bij voedsel gerelateerde uitbraken
Eelco Franz (RIVM)
Precision epidemiology
Simon de Jong (Amsterdam UMC)
Virus WGS ten behoeve van internationale publieke gezondheid
Richard Molenkamp (ErasmusMC)
SARS-Cov-2 transmissie bij zorgmedewerkers
Jelle Koopsen (GGD Amsterdam)
WGS in het kader van eliminatie van HCV
Janke Schinkel (Amsterdam UMC)
WGS bij Mpox
Matthijs Welkers (Amsterdam UMC)
WGS bij een VRE uitbraak
Sebastien Matamoros (Amsterdam UMC)
WGS voor Candida auris
Joanna Rhodes (Radboud MC)
Discussie aan de hand van enkele stellingen
Evaluatie
Afsluiting en aansluitend borrel